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問題：在沒有標準品的情況下，確定未知物質結構，，利用MassWorks 測定結果會不會與實際測的結果有更大的偏差?

回答：不會的!低分辨質譜經過MassWorks校正處理后的質量準確度提高了100倍，能夠測定至0.00x Da，再加上同位素峰形的譜圖準確度的對比，MassWorks能幫助我們過濾掉99%以上的假陽性結果，直觀地識別出準確的分子式。在高分辨儀器上,過分的依賴質量準確度倒是很可能產生錯誤的結果,而譜圖準確度可以對錯誤的結果提供診斷信息。

 

問題：MassWorks只與安捷倫合作了嗎?還有其它公司嗎?

回答：目前MassWorks與安捷倫在GC/MS方面開展了合作, 在GC/MSD推出了獨特的質量準確度和譜圖準確度兩項指標,外加AutoCal(自動校正)功能和優惠的打包捆綁價格, 以提升安捷倫GC/MS平臺的定性能力。

其它公司(Waters、Bruker四極桿質譜、Shimadzu液質、PerkinElmer四極桿氣質、Thermo、Advion)雖沒有開展類似的合作，但是這些公司質譜采集的數據能被MassWorks直接讀取和處理。在其它質譜儀(如Bruker 公司TOF儀器和自制的質譜儀)上獲取的質譜數據，只要是連續(continuum)或輪廓圖(profile mode)數據,也能導入MassWorks處理。

 

問題：MassWorks軟件是否適用于無機質譜的數據分析?

回答：這個問題提得好。由于無機離子的同位數信息更豐富多彩,如Fe, Hg, Ru等, 外加相互間的干擾較重,MassWorks中的校正和分析技術其實更適合于無機質譜的數據分析。目前版本MassWorks可以通過數據的導入進行無機質譜數據的處理和分析。

 

問題：對于一些質譜軟件，得到的只是數據，而不是譜圖，比如PE家的，MassWorks怎么實現其功能呢?

回答：PE公司平臺的四極桿氣質MassWorks亦能直接讀取，數據處理方法與安捷倫等相似。其它平臺如TOF等只要能生成連續(continuum)或輪廓圖(profile mode)數據,也能導入MassWorks處理。

 

問題：譜圖準確度是什么?能否詳細解釋？

回答：譜圖準確度代表校正后的實驗質譜圖(含同位素分布,理想峰形和測量誤差)與理論質譜圖(含同位素分布和理想峰形但不含測量誤差)之間的相似程度, 詳情請參見這篇<<分析化學>>的封面文章(全文免費下載): http://www.cernobioscience.com/resources/ac100888b.pdf 。

擴展閱讀：http://www.antpedia.com/news/90/n-106690.html[未知物鑒定：1ppm不夠，譜圖準確度幫大忙]

 

問題：如果需要校正，是每做一個低分辨數據就需要進樣一個調諧液樣品嗎?

回答：對低分辨的液質，一天做一次標樣校正就足夠,只要質譜的采集條件如掃描速度和質量范圍等保持不變。由于質譜和色譜的相對獨立, 一天一次標樣可以通過外標的形式以直接注入(infusion)或快速色譜來采集。對低分辨的氣質特別是安捷倫的GC/MSD, 由于調諧液樣隨機帶有,方便調用,建議在每個樣品分離結束時先快速降溫(以免色譜柱上的材料流出形成干擾),再打開調諧液進樣閥門1-2分鐘來采集MassWorks校正所需的(近似于內標的)標樣數據。我們做過長達3周的實驗,發現在這類儀器上只要不調諧并保持質譜的采集條件如掃描速度和質量范圍等不變,儀器的飄移在0.00x之內,而譜圖準確度不受影響。實驗室的詳情請見:

　　http://www.cernobioscience.com/resources/ASMS2008/RobustnessofFormulaDeterminationSingleQuadGC-MSThPE141.pdf

在高分辯儀器如TOF上,由于用的是未知物本身的單同位數峰(Monoisotope)只對峰形作自我校正(sCLIPS),無需任何標樣。

 

問題：峰型函數可以運用到所有峰的校正嗎?

回答：峰形函數和質量誤差與質量范圍有關,所以在低分辨儀器上要用能夠涵蓋質量范圍的混標,如氣質和液質上用的調諧液。在高分辯儀器如TOF上,由于用的是未知物本身的單同位數峰(Monoisotope)只對峰形作自我校正(sCLIPS), 每個離子都是單獨不同分別校正的。

 

問題：在島津軟件能否用massworks軟件?

回答：島津公司的GC/MS不能使用MassWorks軟件，因為島津GC/MS工作站不能采集原始數據(continuum 或profile數據)。

島津四極桿液質(單四極桿和三重四極桿)可以使用，MassWorks能支持直接讀取。IT-TOF數據也能被MassWorks分析，只需將要分析的目標峰的質譜圖導入至MassWorks即可。

 

問題：用氣質做大氣污染源監測時，由于污染源成分復雜，MassWorks能否幫我們的單四極桿氣質做到定性與定量?如何定量?

回答：只有這些復雜的成分在下述情況下

　　(1) 色譜上不能分離時(即共流出), 其相關離子的質譜峰不相互重疊

　　(2) 其相關離子的質譜峰相互重疊時, 色譜上能以保留時間分離

　　MassWorks則能有效使用。我們有不少用戶將MassWorks用于大氣污染物中未知成分的鑒定和有害物質的確證分析。只有在色譜上不能分離(即共流出)的同時相關離子的質譜峰又相互重疊的雙重條件下, MassWorks才會因干擾而會通過很差的譜圖準確度告訴用戶有干擾的存在。

MassWorks暫不能用于定量分析。

 

問題：對蛋白質組研究來說，主要是肽段、氨基酸片段測量，不知道MassWorks種矯正方法能否用在復雜樣品測序中?

回答：基本原理很適用但目前的版本暫不能做大分子的測序而只能作已知大分子的降解或轉化定量分析,如deamidation 或 deamination。

可以參考：http://m.taannuo.com/news/n_id-326.html利用MassWorks譜圖準確度定量脫酰胺基肽的含量

 

問題：MassWorks現在能支持安捷倫7000C的MassHunter采集時的自動校正嗎?

回答：MassWorks能支持這類儀器的數據直讀,但暫不能象GC/MSD那樣進行AutoCal (自動校正) 。

 

問題：MassWorks用于液質時，推薦使用什么物質作為校準物質?

回答：可用Agilent公司的調諧液,也可自配小分子藥物的混標。

 

問題：我們實驗室做液質校準時，用氯霉素來做校準物質，效果不太好，請問會是什么問題呢?

回答：請將具體數據與綠綿科技的李斌工程師共享，我們共同找出具體的原因和解決辦法。

 

問題：MassWorks是所有的元素的同位素都可以計算嗎?

回答：是的，含元素周期表中所有的元素。

 

問題：MassWorks對數據的量有要求嗎?0.1AMU/點就可以嗎?

回答：MassWorks要求采集的閾值必須為0，采集步長0.1u就可以了。

 

問題：目前有免費開源的做譜圖校正的軟件嗎，性能與massworks的差距有多大?

回答：沒有類似開源軟件,因我們有多處的保護。

 

問題：MassWorks是如何通過譜圖與理論譜圖的差異，預測化合物的C可能在4-15之間呢?

回答：Since the ¹³C relative abundance is roughly 1% and a typical A+1 isotope is dominated by ¹³C with smaller contributions from other higher isotopes such as ¹⁵N, ³³S, ²H etc., the A+1 isotope peak intensity (relative to the monoisotope peak intensity) is a good indicator for the number of carbon atoms contained in a given ion. For example, for an ion containing 10 carbons, the A+1 relative intensity should be around 10%. Therefore, a candidate formula with only 4 carbons would have its A+1 isotope significantly lower than the 10% observed in actual data while a formula with 15 carbons would have its A+1 isotope significantly higher than the 10% observed, indicating that the correct carbon number should be between 4 and 15.

 

問題：用MassWorks是不是需要逐一分析每個化合物? 能否提供終匹配度高的報告?

回答：所有化合物的準確質量數據在校正完成后一次性獲得，但是元素組成的分析需要逐一分析感興趣的組分。MassWorks會根據譜圖準確度和質量準確給出分子式分析結果，譜圖準確度高的分子式位于結果的位，分子式分析結果包括理論質量、質量誤差、譜圖準確度、不飽和度等非常實用的信息。

 

問題：這個軟件可否用于分析預測未知化合物的分子式?

回答：可以!MassWorks的功能就是得到化合物的分子式，類似于高分辨質譜，對譜庫中沒有的那種未知化合物, MassWorks是一種強有力的定性工具。

 

問題：MassWorks如何用于AB Sciex QTRAP的數據?

回答：MassWorks使用方法與安捷倫氣質類似，校正標樣可以采用您實驗室的任何標準物質。標物和實際樣品可以在同一次運行中采集做內標校正(可能會有相互干擾)，也可以分開采集標物和實際樣品的數據做外標校正(可避免相互干擾)。

 

問題：MassWorks用于液質和氣質上有區別嗎?

回答：MassWorks液質和氣質的結果本質上沒有區別!只是由于氣質儀器上帶有調諧液，使用起來比液質方便。

 

問題：MassWorks與高分辨質譜相比,在未知物結構鑒定中是否也具有使用的意義?

　　比如說在譜庫中沒有標準譜圖的前提下，MassWorks是否也可以通過分析得到未知物質的化學結構?

回答：MassWorks能提供目標化合物的分子離子、碎片離子的準確質量信息及它們準確的元素組成，目前MassWorks還不能直接得到結構。對于結構分析，只能是通過分子離子和碎片離子的元素組成做人工推測。高分辨質譜得到的結果也是這樣，目前還沒有一款真正有效的結構解析軟件。

 

問題：MassWorks能用于安捷倫6550Q-TOF上嗎?

回答：可以!用途在于通過譜圖準確度來進一步提升分子式確定的準確性。詳情請見這篇在Orbitrap上的應用文章: http://dx.doi.org/10.1016/j.jasms.2009.07.014 。

 

問題：GCMS分析樣品時，是否要加入標樣開啟和關閉步驟呢?這里說的標樣是說GCMS的調諧樣品嗎?

回答：正確!建議在每個樣品分離結束時先快速降溫(以免色譜柱上的材料流出形成干擾),再打開調諧液進樣閥門1-2分鐘來采集MassWorks校正所需的(近似于內標的)標樣數據。

 

問題：從色譜的共流出化合物會同時進入質譜，他們的質譜峰將會重疊，如何分開重疊的峰?

回答：在下述情況

　　(1) 色譜上不能分離時(即共流出), 如其相關離子的質譜峰不相互重疊;或者

　　(2) 其相關離子的質譜峰相互重疊時, 色譜上能以保留時間分離

MassWorks則能有效使用。只有在色譜上不能分離(即共流出)的同時相關離子的質譜峰(只有幾個AMU的范圍內)又相互重疊的雙重條件下, MassWorks才會因干擾而會通過很差的譜圖準確度告訴用戶有干擾的存在。

 

問題：在實際分析中，比如說GC-MS，GC的流出物源源不斷的流入質譜，如果采用EI源，待測物的碎片峰將混在一起，如何提取每一種分析物的純凈質譜圖呢? NIST退卷積主要是采用模型峰的方法，在您的軟件里如何處理的呢?

回答：MassWorks在這方面暫時還沒有處理辦法。

 

問題：MassWorks在藥代方面有什么應用?

回答：MassWorks在這方面的應用有用于¹⁴C取代的混合物分析。

 

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